Die DGPF wurde am 22. November 2001 in Martinsried im Max-Planck-Institut für Biochemie gegründet. Ihre ca. 300 Mitglieder kommen aus dem akademischen Bereich und aus 3 Unternehmensgruppen des Life Science Umfelds: kleine und mittlere Biotech- Start-Up-Unternehmen, etablierte Anbieter von Technologien der biochemischen Analytik und Großunternehmen der pharmazeutischen Industrie.

Die DGPF versteht sich als Plattform, um die in Deutschland an verschiedenen Standorten und im Rahmen unterschiedlicher Programme angelaufenen Proteomik-Aktivitäten unter einem Dach zusammenzuführen und darüber hinaus die Proteomforschung durch national und international abgestimmte Initiativen voranzubringen. Durch eine übergreifende Koordination soll eine Bündelung und optimale Nutzung der nationalen Forschungskapazitäten herbeigeführt werden, um im weltweiten Wettbewerb an führender Stelle bestehen zu können.

Die in der DGPF angelegte Zusammenarbeit von Wissenschaft und Wirtschaft ist ideal geeignet, den Technologietransfer zu begünstigen und wird dadurch direkt den Wirtschaftsstandort Deutschland und seine Wettbewerbsfähigkeit im internationalen Vergleich stärken.